1、对于具有同源性的两个蛋白我们可以从结果，功能，定位三个方面去比较两个蛋白，注意蛋白之间即使编码序列不相似也有可能是同源的
2、对于拓扑结果可以利用一些生物信息学方法预测，
3、对于功能我们可以采用基因突变的方法研究
